Η διέγερση ολοκληρώνεται όταν τα ωοθυλάκια φτάσουν στο κατάλληλο μέγεθος (διάμετρος μεταξύ 18 και 20 χιλ.) και με αυτόν τον τρόπο καθορίζεται η ημέρα και η ώρα της συλλογής των ωαρίων δύο ημέρες αργότερα. Προκειμένου να επιτευχθεί μεγάλος αριθμός ώριμων ωοκυττάρων, χορηγείται υποδόρια ένα ειδικό φάρμακο και η ανάκτηση ωαρίων προγραμματίζεται 34-36 ώρες αργότερα. Κατά τη διάρκεια της συλλογής ωαρίων είναι παρούσα μια ολόκληρη ομάδα, αποτελούμενη από έναν αναισθησιολόγο, έναν ειδικά εκπαιδευμένο και πιστοποιημένο γυναικολόγο, και μια-δυο μαίες και εμβρυολόγους.
Η συλλογή των ωαρίων πραγματοποιείται διακολπικά με τη βοήθεια υπερηχογραφικής παρακολούθησης και υπό αναισθησία.
Η διαδικασία είναι ανώδυνη και απαιτεί μόνο ξεκούραση 30 λεπτών έως 1 ώρας μετά την ολοκλήρωσή της. Συνιστάται ιδιαίτερα σε όλους τους ασθενείς να μην είναι μόνοι τους και να μην οδηγούν για το υπόλοιπο της ημέρας για τη δική τους ασφάλεια.